实验分析命令:exp
bohr exp 提供 PXRD、NMR 和电子显微镜分析工具。
命令
| 命令 | 用法 | 说明 |
|---|---|---|
ems | bohr exp ems [flags] | 分析电子显微镜图像中的颗粒 |
nmr | bohr exp nmr [flags] | 检索、预测或反演预测 NMR 谱图 |
pxrd | bohr exp pxrd [command] | 调用 PXRD API 进行粉末 X 射线衍射分析 |
命令组内的子命令请运行 bohr exp <组> --help 查看。
常用参数
| 参数 | 说明 |
|---|---|
--output-dir <dir> | PXRD 输出目录 |
--input <file> | PXRD 图谱文件 |
--cif <file.cif> | 模拟或比较使用的晶体结构 |
--top-n <number> | PXRD 最大候选数量,默认 5 |
--task <predict\|search\|reverse-predict> | NMR 任务类型 |
--smiles <value> | NMR 预测使用的分子 SMILES |
--image <file> | 电子显微镜图片 |
示例
bohr exp pxrd parse --input ./pattern.xy --output-dir ./pxrd-result
bohr exp pxrd simulate --cif ./model.cif --output-dir ./pxrd-result
bohr exp nmr --task predict --smiles CCO
bohr exp ems --image ./sem-image.png
PXRD 命令会将结果写入 --output-dir。EMS 支持不超过 20 MiB 的 PNG、JPEG 和 TIFF 图片。