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动态与公告

【产品更新】Bohrium 全新改版，新增论文推荐和公共数据库​

发布时间：2024-04-07

本次更新为 2.0.0 版，主要包括：

  1. Bohrium 全新改版：视觉体验全面升级，原案例广场并入主站，浏览内容更便捷

  2. 论文推荐全新上线：最懂你的个性化论文推荐引擎，帮你发现最值得读的新文献

  3. 新增公共数据库：拥有百万级海量数据资源，为科学计算提供强大助力

【产品更新】存储系统升级：新增用户个人存储空间 /personal​

发布时间：2023-12-27

本次更新为 1.9.2 版，主要包括：

存储系统升级，新增用户个人存储空间 /personal。

  1. /personal 的特点：

  • /personal 为用户个人文件的存储空间，并非某一项目下的存储空间。

  • 仅用户本人可访问，其中的文件可在任何项目下使用。

  1. /personal 的空间容量：

    每位用户将获得 500GB 的免费存储空间，如您需要更大的存储空间，请联系 bohrium@dp.tech 进行申请。

  2. 使用建议：建议您将个人私有文件存放至 /personal 下，将归属于项目的公共文件存放在项目下的 /share 盘内。

注意：

  • /data 盘因为存在各种弊端，拟计划在 2024 年 1 月底停止服务。请您及时将需要保留的数据迁移至 /personal 或项目下 /share 盘内。
  • 我们将会在 2024 年 1 月中旬上线盘内文件一键迁移功能，协助您进行数据迁移。

附：/personal、/data、/share 的对比：

区别/personal/data/share
读写权限仅用户本人可读可写用户本人及项目管理员可读可写项目下全部人员均可读可写
可使用范围任意项目下，均可访问该盘内文件仅在盘归属项目下，可访问该盘内文件仅在盘归属项目下，可访问该盘内文件
挂载至节点支持，可挂载在任意项目下的节点上支持，仅可挂载在盘所属项目的节点上支持，仅可挂载在盘所属项目的节点上
通过-r自动下载任务结果至盘内支持支持支持
容量扩容支持不支持支持

【产品更新】新增任务结果可视化分析模块，文件支持批量上传下载​

发布时间：2023-11-16

本次更新为 1.9.1 版，主要包括：

  1. 任务结果支持可视化分析

    • 对于 DeepMD-kit 模型训练任务，任务详情页面自动展示训练损失图和学习率变化曲线，支持鼠标滚动缩放和拖动查看等多种交互操作

    DPMD-训练曲线

    • 任务详情页的【实时文件】模块现支持图片和结构文件的预览，可以实时预览 VASP、LAMMPS、GROMACS 等多种软件计算过程中的动态轨迹和结构变化，还支持鼠标滚动缩放和旋转结构等一系列交互操作

    实时预览

  2. 文件管理页面上传下载功能更新

    • 文件支持批量上传和下载

    • 新增文件传输列表，文件传输时支持取消或重试，上传下载均有记录

    • 下载过的内容，可以在传输列表内再次快速下载，也可一键复制下载地址并分享给他人

  3. Notebook 体验优化

    • Notebook 页面加载速度大幅提升

    • 代码单元格可见行号和缩进，运行时展示各种状态标志，支持一键运行代码单元格并查看运行时间

    • 案例广场 Notebook 左侧目录支持跳转，多级目录支持展开和收起

    • 在编辑 Notebook 时，支持使用终端登录 Notebook 节点，可进行环境安装和配置并实时生效

  4. 镜像中心升级改造

    • 公共镜像全面改版，现按照软件进行聚合，并标明了其中包含的各类软件

    • 支持使用 Dockerfile 创建镜像，并可查看构建日志

    • 开发机构建镜像时，支持排除不必要路径，以降低镜像大小，提升镜像拉取速度

    • 已删除的镜像 tag 现支持重复使用

  5. 其他功能更新

    • 新增 Bohr 翻译助手，可一键将案例广场上的 Notebook 全文翻译成中文或英文

    • 在任务运行过程中，支持用户在计算节点上进行文件增/删/改等多种操作来辅助任务结果分析

    • 机型全面放开，在提交任务、开启容器节点、运行 Notebook 等多个场景下可按需选择机型使用

    • 支持移动端充值；充值记录支持查看并可自助申请发票

    • 新增用户 ID，可在新增用户 ID，可在顶部导航栏（含移动端）、个人中心、账户设置中查看

【产品更新】Notebook 全面升级，支持协同编辑和创建 Notebook 合集；新增项目共享盘，支持项目内文件共享；新增 Bohrium 用户主页；集成 Bohr 代码助手​

发布时间：2023-09-25

本次更新为 1.9.0 版，主要包括：

  1. Notebook 全面升级，现支持私密分享、公开发布以及协同编辑；编辑 Notebook 时可连接已有节点

    • 访问 Bohrium 案例广场，点击 “写 Notebook” 按钮，即可快速新建一篇 Notebook
    • 运行 Notebook 时，除了新建一个新的 Notebook 节点，还可通过 “连接已有节点” 选项使用已配置好的容器节点
    • 若需邀请他人协同创作 Notebook，可以点击页面右上角的 “分享” 按钮实现协同编辑
    • 完成创作的 Notebook 可选择私密分享或公开发布两种方式，Bohrium Notebook 均予以支持

  2. 新增 Notebook 合集功能，可进行浏览或创建 Notebook 合集

    • 在 “全部合集” 页面，可自由浏览或关注现有的 Notebook 合集，同时显示阅读进度
    • 通过点击“我的主页-我的合集”，可以查看自己创建的和关注的 Notebook 合集，并支持新建合集
    • 在案例广场阅读 Notebook 时，可快速将单篇 Notebook 加入至合集中

  3. 支持项目文件内共享功能

    • 新增共享盘（/share），该目录下的文件可供项目成员共享；计算结果、实时文件以及案例广场的 Notebook 均可保存至共享盘

  4. 支持在容器节点开机时挂载数据集

    • 当容器节点开机时，可选择所需数据集进行挂载。挂载完成后，您可以通过命令行访问数据集文件，或在 Notebook 编辑页面中进行访问

  5. 新增 Bohrium 用户主页，展示个人创建或关注的 Notebook 及参与的比赛

    • 在 Bohrium 所有页面上，通过点击用户头像，可快速跳转至用户主页。在该页面上，可以查看用户成长等级、关注的用户、创建和关注的单篇 Notebook 和 Notebook 合集以及参与的比赛

  6. 集成 Bohr 代码助手

    • 运行案例广场上的 Notebook 时，若出现代码报错，Bohr 代码助手会自动针对错误单元格提供解答；此外，选中代码单元格中的某段代码后，会自动弹出“代码解读”按钮，点击后 Bohr 代码助手会对选中代码进行解读

    • 在创作 Notebook 时提供自动报错解答功能

【产品更新】新增 Bohrium 数据集​

发布时间：2023-08-15

本次更新为 1.8.1 版，主要包括：

  1. 新增 Bohrium 数据集，可制作数据集用于任务提交、数据共享，进行版本管理、权限管理等。

    现在，当您遇到以下问题时，均可以通过将数据制作为数据集的方式来解决，如：

    • 提交任务的时候，输入文件大、任务提交慢；

    • 提交任务的时候，输入文件需要频繁复用；

    • 需要和其他用户或项目共享文件。

【产品更新】首页改版，新增 Bohr 助手；新增查看计算节点运行监控；支持自定义通知发送渠道；Bohrium Notebooks 内支持评论​

发布时间：2023-07-20

本次更新为 1.8.0 版，主要包括：

  1. 首页全面改版，新增 Bohr 助手

    • Bohrium 首页分为：使用引导、最近使用和 Notebooks 三大模块。

      • 使用引导：分场景下提供使用引导，协助新用户快速上手，老用户也可将此处作为功能快捷入口；

      • 最近使用：展示用户最近提交的任务、使用的文件以及节点，用户可快速获取信息及操作；

      • Notebooks：展示最热最新的 Notebooks 案例。

    • 新增 Bohr 人工智能助手，能够回答任何复杂的问题，还可以帮你写代码、解释代码含义、排查错误等，在 Bohrium 全站均可使用。

  1. 任务状态调整细化，支持查看计算节点监控

    • 任务状态全面细化，您可清晰的了解自己的任务当前运行进度；

    • 识别常见的任务失败原因：如 OOM、命令不存在、程序异常等；

    • 任务运行中，可在任务详情页内查看该任务计算节点机器的运行监控，及时发现运行异常。

  1. 消息通知支持自定义设置

    • 点击页面右上角头像找到通知设置，对各种消息通知的发送渠道进行自定义配置，根据您的接收喜好了解您的任务及账户变动。

  2. Bohrium Notebooks 内支持单元格评论

    • 点击一篇 notebooks 单元格右上角的评论按钮，可对当前单元格进行评论，当然您也可以对已有的评论进行回复；

    • 当您发表的 notebooks 收到新评论或您发表的评论收到新的回复时，您的 Bohrium 消息中心内将收到通知。

  3. 其他细节体验优化与问题修复

【产品更新】增加了网页提交任务支持的软件、可提交多节点任务；全部任务支持一键复制，高效提交任务；管理节点支持域名连接​

发布时间：2023-05-23

本次更新为 1.7.13 版，主要包括：

  1. 网页提交任务功能更新：

    • 增加了支持的软件。当前 DeepMD-kit、ABACUS、LAMMPS、 GROMACS、CP2K、Quantum Espresso 几款软件，均支持使用网页提交功能进行任务提交；

    • 输入文件支持上传文件夹；

    • 支持提交多节点并行任务；

  2. 全部任务均支持一键复制重新提交。你是否遇到过以下情况？

    • 新提交的任务只需要修改历史任务的某个参数，但是还需要准备整个输入文件夹，好麻烦；

    • 任务提交后发现配置错了，想要快速修改后重新提交；

    现在，复制功能可以帮你快速解决上面的问题，只需在“任务列表”内找到想要复制的任务，一键复制后，修改、提交即可。

  3. 支持使用域名连接管理节点，关机重启后，域名保持不变。

【产品更新】Notebook 支持自定义镜像，Web Shell 体验升级​

发布时间：2023-05-18

本次更新为 1.7.10 版，主要包括：

  1. 支持用自定义镜像运行 Notebook，点此了解镜像要求；

  2. 优化了 Notebook 的使用体验：

    • 作者本人可以预览分享页，作者在分享弹窗中可查看分享页浏览量；
    • 移动或重名命 Notebook 不再会影响分享链接；
    • Notebook 运行时显示节点 GPU/CPU 利用率、显存/内存等信息；

  3. 优化了 Web Shell 的使用体验：

    • 支持收起左侧目录树，终端放大和全屏的体验优化；
    • 点击打开的文件，可以自动定位到文件树对应位置；
    • 材料可视化支持更多文件类型：如.poscar/.contcar/.vasp等常见结构文件及其变体，.dump/.lammps/.lammpstrj/.lmp/.conf 等常见轨迹文件及其变体；
    • 默认使用文本编辑器打开未知类型文件；
    • 优化了实时保存、图片缩放、格式错误校验、终端内文字复制提示等细节体验。

【产品更新】新增实时查看计算中任务计算结果；支持拉取 DockerHub 镜像；新增 Web Shell 在线解压​

发布时间：2023-04-04

本次更新为 1.7.0 版，主要包括：

  1. 无需等待任务结束，任务运行中就可以在任务详情内方便的实时查看计算中产生的结果文件啦~

  • 您可以在任务详情内点击实时文件，直接查看其内容；也可以将需要查看的实时文件下载到本地或直接保存至 data，进行后续的处理。

  • 运行中产生的实时文件将为您保留一段时间，您可以在需要的时候随时进行查看和保存。

  1. 公网上已存在的镜像，无需手动搬运。可直接拉取 DockerHub 公共仓库内镜像，将其制作为自定义镜像，直接在 Bohrium 上使用，点此了解具体制作方法（目前该功能正在逐步灰度放量中）。

  2. Web shell 支持在线解压。

【产品更新】新增网页提交任务，更简单、快捷；任务可一键复制，相同的配置可直接复用​

发布时间：2023-02-06

本次更新为1.6.0版，主要包括：

  1. 您是否遇到了这种问题：

    初步使用 Bohrium 不知道如何上手？

    不熟悉 Linux 命令？

    想快速跑个简单任务，准备 job.json 太麻烦。

    使用网页提交任务可以解决您的困扰，只需选择需要使用的软件、上传输入文件、完成软硬件配置，即可完成简单任务的提交。

  2. 网页提交的任务可一键复制，可将常用的软硬件配置保存为常用模版，使用时一键复制模板即可。

  3. 向并行提交的任务，可在运行中查看文件；您可至任务详情页，使用 SSH 连接至计算节点。

【产品更新】新增自助充值​

发布时间：2023-01-17

本次更新为1.5.3版，主要包括：

  1. 新增 Bohrium自助充值，支持用户在系统内自助进行小额充值，充值流程更加简单、方便。

【产品更新】新增磁盘容量不足提醒，优化自动下载功能​

发布时间：2022-12-29

本次更新为 1.5.2 版，主要包括：

  1. 新增磁盘容量不足提醒，当您的管理节点系统盘使用量 ≥80% 时，节点将会展示当前使用量并给您发送容量不足预警消息，请您及时清理不需要的文件，避免因磁盘容量满导致的无法回收计算结果等问题。

  2. 自动下载功能优化

  • 除 Bohrium 管理节点外，本地提交的任务也可在提交任务时用 lbg job submit -r /data 进行结果自动下载路径指定。

  • 节点无需保持运行状态，系统会在任务完成后将结果下载至数据盘内您指定的目录下。

注意：自动下载仅可指定下载至数据盘目录下，参数 -r 后的指定路径请以 /data 开头，任务完成后您可进入对应项目的数据盘进行查看。

  1. Bohrium Notebook 新增代码自动补全（需节点在运行状态）并进行了其他体验优化。

  2. 其他细节体验优化与问题修复。

【产品更新】新增 Bohrium Notebook​

发布时间：2022-11-25

本次更新为 1.5.1 版，主要包括：

  1. 新增 Bohrium Notebook 功能，提供一站式编写和运行代码的交互式环境，提升开发协作体验。

【产品更新】新增管理员角色、项目管理者可管理成员节点及任务，无需开机即可访问数据盘，镜像制作中可提交任务​

发布时间：2022-11-22

本次更新为 1.5.0 版，主要包括：

  1. 支持设置项目管理员及批量管理成员，有效提升项目的管理效率，管理员详细权限可查看项目角色及权限说明；

  2. 项目管理者可管理项目全部节点及任务，如登录成员节点、查看成员任务进度、协助成员解决 bug 等，团队协作效率高，信息更同步；

  3. 无需开机即可访问数据盘，节点关机状态时点击“ SSH 连接”按钮即可直接访问数据盘，文件管理更便捷；

  4. 无需等待镜像创建完成，即可使用其镜像名称提交任务，更加节省时间。


【产品更新】新增自动关机、成员预算、消息中心，Web Shell登录计算节点时的命令限制放开​

发布时间：2022-09-28

本次更新为1.4.0版，主要包括：

  1. 新增管理节点自动关机功能，用户可根据需求指定关机时间，系统将在距离关机约10分钟时发送消息提醒；
  2. 新增成员预算功能，项目管理者可指定每位成员的花费上限，适用于课题组费用管理、课堂教学、workshop上机等场景；
  3. 新增消息中心，当余额或预算不足、任务失败、节点/快照/镜像创建失败等异常发生时，会推送消息给您。为避免打扰，5分钟内有多条任务失败时，仅推送首条；
  4. Web Shell登录计算节点时，仅可执行白名单内命令的限制已放开，计算节点环境支持的命令均可执行；
  5. Lebesgue Utility支持命令自动补全，除更新到最新版外，您还需要在rc文件中添加自动补全相关配置；

【产品更新】支持自动下载计算结果，新增任务详情页​

发布时间：2022-09-05

本次更新为1.3.0版，主要包括：

  1. 支持自动下载计算结果到管理节点，您可以在提交任务的脚本中增加一行 result 字段来指定目录，如：

     "result":"./result/"

    也可以在提交时用 lbg job submit -r ./result 参数来指定；

    注意：该功能只支持自动下载结果到Bohrium管理节点，且该节点在任务完成时需要处于运行中状态。

  2. 新增任务详情页，可查看任务生命周期、计算节点状态等信息，支持在Web端终止任务；

  3. 新增任务视图，支持搜索任务ID或任务名；

  4. 新增支持pdb、sdf、mol、mol2格式的结构文件在线查看，提升了Web Shell打开轨迹文件的速度；

  5. 优化了提交任务所用的json文件中有错误时的提示信息；

  6. 其他细节体验优化与问题修复。


【产品更新】Bohrium 1.2.0更新，可指定任务最大运行时长​

发布时间：2022-08-11

本次更新主要包括：

  1. 提交任务时可指定最大运行时长，例如在配置文件中指定"max_run_time": 1440,即表示任务最大运行时长为24小时（1440分钟），当超过24小时仍未结束时，系统将自动中止（terminate）该任务并保存已产生的计算结果文件；
  2. 优化价格计算器页面样式；
  3. 其他细节体验优化与问题修复。

【产品更新】Bohrium 1.1.2更新，支持轨迹文件播放​

发布时间：2022-07-27

本次更新主要包括：

  1. 管理节点数据盘的可视化预览功能中，支持dump等轨迹文件的播放；
  2. Lebesgue Utility新增 log machine ls命令，可查看所有可选的机型配置；
  3. 其他细节体验优化与问题修复。

【产品更新】Bohrium 1.1.1更新，支持跨项目共享镜像​

发布时间：2022-07-15

本次更新主要包括：

  1. 支持跨项目共享镜像，您可以将制作好的软件、数据等以镜像的方式分享给任意指定用户；
  2. 每个项目的自定义镜像数提升至10个。
  3. 项目创建者可以暂停或释放项目成员创建的节点；
  4. 新增部分常用软件的镜像，您可以在“镜像中心”页的公共镜像列表中查看；
  5. 其他细节体验优化与问题修复。

【产品更新】Bohrium 1.1.0发布，管理节点新增 1TB 数据盘，支持常见文件格式在线预览​

发布时间：2022-07-01

本次更新主要包括：

  1. 管理节点新增 1TB（即 1024 GB）数据盘，可持久存储您的数据与文件，不随节点释放而删除；
  2. 管理节点数据盘中的文件支持可视化管理，您可以在线预览结构与图片、在线编辑脚本与参数文件；
  3. 其他细节体验优化与问题修复。

注： Lebesgue Utility有接口升级，建议老用户在终端中更新至最新版本，否则可能影响使用：

pip install -U lbg

如出现安装过慢，请尝试使用国内源：

pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple/ lbg

【产品更新】Bohrium 1.0.0发布​

发布时间：2022-06-22

本次更新主要包括：

  1. 支持在Bohrium上使用ABACUS和CP2K进行第一性原理计算，使用LAMMPS进行分子动力学模拟，支持使用DeePMD-kit与DP-GEN进行机器学习势函数的训练与构建。
  2. 【网页端】新增Web Shell，免登录一键连接管理节点；支持通过Web Shell访问计算节点，便于查看计算节点任务进度；
  3. 项目余额升级为项目预算，您无需再转账进项目，项目产生费用时会直接从账户余额中扣除。如需控制项目预算，您可以在项目管理页设置；
  4. 交互和视觉体验优化、新增帮助中心、公共镜像更新等其他优化。